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在 circlize 中绘制 chordDiagram 时出错:“Circos.initialize 中的错误"

当我尝试在 circlize (R) 中绘制 chordDiagram 时,出现持续性错误.我能够用一个数据集(Data1)很好地生成图,但不能用另一个(Data2)来生成图,它在结构上是相同的(据我所知).下面复制了两个数据集.它们具有相同的尺寸和结构——我想!'Year' 和 'month' 都被认为是具有相同级别数的因素,而 'mean' 是一个数字.两个数据集都被 R 识别为数据框.我一定 ..
发布时间:2021-06-18 19:20:35 其他开发

R Circlize,带有空扇区的和弦图

我正在尝试使用R中的circlize包创建一个和弦图.我想包括没有流出的扇区(没有从它们发出的链接).有没有办法: 强制该程序报告我数据框中的行,即使该行中只有零. 抑制自循环. (小插图呼吁您在对角线输入零,但这要回到第一个问题.) 我已附上我的代码. chordDiagram(mat, symmetric = TRUE, keep.diagonal = TRUE, or ..
发布时间:2020-07-19 20:33:13 其他开发

包装中的分组轨迹在R中循环

我在这里创建了类似于circlize教程第8页上的图: http://cran.r-project.org/web/包/circlize/vignettes/genomic_plot.pdf 现在,我试图在基因名称的上方覆盖一条额外的轨道,该轨道显示将基因分组为更大的类别(在下图中的插图中,我试图添加蓝线,希望得到带有circlize的漂亮图片). 我有一个新的数据框,其中包含每个较宽 ..
发布时间:2020-07-19 20:32:08 其他开发

R:在圆图中调整标签

我有下面的代码,我试图使用令人惊叹的软件包circlize将其制作成圆形图 我已经阅读过小插页,并承认其中有些已经超出我的头顶了, 我想知道是否有一种快速的方法来删除图表上的所有标签,包括刻度线,并按照此示例 library (dplyr) library(circlize) df = read.table(textConnection(" Brand_from model_ ..
发布时间:2020-07-19 20:32:04 其他开发

旋转和弦中的标签

这是circlize包中的一些代码,用于创建和弦图.是否可以将标签垂直于圆形旋转90度? library(circlize) set.seed(999) mat = matrix(sample(18, 18), 3, 6) rownames(mat) = paste0("Start", 1:3) colnames(mat) = paste0("End", 1:6) chordDiagrm(m ..
发布时间:2020-07-19 20:32:01 其他开发

R从数据框中制作带圆圈的圆/弦图

我想使用circlize软件包制作一个和弦图.我有一个包含四列汽车的数据框.前两列包含有关所拥有的汽车乐队和车型的信息,后两列包含被调查者迁移到的品牌和车型的信息. 这是数据框的一个简单示例: Brand_from model_from Brand_to Model_to 1: VOLVO s80 BMW 5series 2: B ..
发布时间:2020-05-28 03:15:02 其他开发

R用对数刻度圆化和弦图

是否可以在circlize程序包中制作一个显示log10值的和弦图?到目前为止,我已经能够生成具有正确尺寸链接的图,但是相应的轴将不匹配.该轴显示每个扇区的所有链接/记录值的总和,这是不正确的,因为求和记录值与原始求和值不对应.有什么办法可以解决这个轴问题? 下面是我到目前为止尝试过的一个例子 library(circlize) export_country ..
发布时间:2020-05-03 08:48:55 其他开发