conda相关内容

Windows cmd git bash:conda.sh没有这样的文件或目录(Windows行尾,缺少斜杠)

我在Windows 10中使用全新安装的Anaconda和Git Bash进行工作.我决定将cmd.exe设置为我的默认控制台程序,以使用git bash(而不是minTTY),而且我认为Unix样式字符与Windows相比已经出现了问题. 当我启动cmd时,Bash告诉我找不到conda.sh文件: bash: C:UsersjoshuAnaconda3/etc/profile.d/ ..
发布时间:2020-07-23 02:19:54 其他开发

conda install -c anaconda gcc_linux-64未使用

我想在没有root用户访问权限的服务器上安装gcc的更新版本.我试过了 conda install -c creditx gcc-7 这是行不通的.然后我发现 conda install -c anaconda gcc_linux-64 实际上安装了gccv7.3.但是成功安装后,conda环境仍在以下位置使用系统gcc /usr/bin/gcc 请帮助我,以便我可以使用刚刚安装的gcc v ..
发布时间:2020-07-23 01:32:06 其他开发

如何在Mac中打开conda shell

我是conda和mac的新手(我主要使用Ubuntu和pip).在Mac上是否有一个conda外壳程序(我想我读过的地方没有内容). 如果是这种情况,我应该如何运行以下命令: conda env create -f environment.yml 如此处要求: https://github.com/datitran/face2face-demo 我打开了Anaconda Na ..
发布时间:2020-07-22 19:49:55 其他开发

在跨平台环境中管理conda env

我的项目应该在跨平台环境(Mac,Win,Linux)上运行. 我创建了一个conda env来管理我们的依赖项,从而简化安装过程. 我想确保每个想要更新enn的人都可以这样做,但是当我尝试将env从linux导出到yml文件时,无法在Win或Mac上正确安装,反之亦然. 我已经尝试做常规的事情: 1. conda env导出> env.yml conda env创建--name - ..
发布时间:2020-07-22 19:49:52 其他开发

康达'源停用'产生错误:参数过多

我正在尝试测试在OS X上通过conda create创建虚拟环境的方法.这是我对虚拟环境的第一次真正的尝试,因此我仍在思考如何使用它们.我的第一个测试是 $ conda create -p /users/me/anaconda/envs/envtest $ source activate /users/me/anaconda/envs/envtest 但是当我通过source deac ..
发布时间:2020-07-22 19:42:07 Python

使用git推送和拉我的conda环境

我的项目中有一个git repo. 我经常更改conda环境,因此我希望我的仓库可以跟踪环境中的变化,并能够推送最新的并将其拉入另一台计算机.是否有可能? 我搜索并找到了几种解决方案(例如 https://tdhopper.com/blog/my-python-environment-workflow-with-conda/),但没有一个提供自动的更改跟踪. 意思是,我要将我在环境中所做的任 ..
发布时间:2020-07-22 19:28:00 其他开发

Spyder无法在Windows 10的Anaconda虚拟环境中运行

这是我在这里的第一篇文章.我试图找到这个问题的答案,但无济于事. 只需在Win10机器上安装Anaconda2(2.7.11 Python内核)即可.我正在尝试学习conda命令.这是我的问题. 我转到Anaconda提示窗口. 我用conda create -n myenv python=3.4命令创建一个虚拟环境. 我用activate myenv激活环境. 当我用conda ..
发布时间:2020-07-14 04:36:20 其他开发

python虚拟环境中的标准库在哪里?

我使用的是默认安装了python 3.5的Ubuntu系统. 当我使用venv模块创建虚拟环境时,我无法在虚拟环境中找到标准库,只能找到python解释器的二进制文件.但是,当我切换为使用此虚拟环境时,可以在python脚本中导入标准库模块. 那么venv如何工作?新创建的虚拟环境是否仅使用系统python的标准库?如果是这样,如果我想创建一个完全独立的虚拟环境该怎么办?是否可以通过v ..
发布时间:2020-07-13 22:33:57 Python

将Anaconda安装到虚拟环境中

我目前可以正常安装想法Python分发在我的计算机上,我不想破坏它,但我想看看移至 Anaconda 来自Continuum. 我可以轻松地将Anaconda安装到我创建的virtualenv目录中,但是我不确定如何告诉virtualenv使用Python的anaconda版本.如果我告诉整个系统使用它,则可以使用export PATH="/DIRECTORIES/anaconda/bin: ..
发布时间:2020-07-13 22:28:42 Python

激活conda环境后如何仍然使用anaconda Python3?

我正在使用MAC OS并安装了python2,然后安装了miniconda python2,然后安装了Anaconda python3. 现在通常在终端中,我的python版本将是python3,但是如果我激活conda环境"test",则默认的python将是python2. 我相信原因是$PATH被更改了,在“基本" env(终端启动时),起始部分是"/anaconda3/bin: ..
发布时间:2020-07-13 20:57:43 Python

在SGE群集问题上的SnakeMake中使用Conda环境

相关:包含Python脚本,conda和群集的SnakeMake规则 我一直在尝试设置SnakeMake管道以在SGE群集(qsub)上运行.使用直接安装到计算节点的简单命令或工具,就没有问题. 但是,当我尝试设置SnakeMake来通过SGE节点上的Conda下载工具时出现问题. 我测试的Snakefile是: rule bwa_sge_c_test: conda: ..
发布时间:2020-07-10 03:45:13 Python

具有Python脚本,conda和集群的SnakeMake规则

我想让snakemake通过SGE集群在特定的conda环境下运行Python脚本. 在群集上,我的主目录中安装了miniconda.我的主目录是通过NFS挂载的,因此所有群集节点都可以访问. 因为miniconda在我的主目录中,所以默认情况下conda命令不在操作系统路径上.也就是说,要使用conda,我需要先将其明确添加到路径中. 我有一个conda环境规范作为yaml文件 ..
发布时间:2020-07-10 03:43:51 Python