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在多台主机上运行并行 R

您能否提供一个脚本,以便在 Ubuntu Linux 机器上从头开始在 2 台主机(amazon ec2)上运行并行集群? 规格 主机通过名为 amazon_key.pem 的身份密钥从本地计算机连接 主机名应该通过亚马逊云提供的内部 IP 地址连接 在设置云时将主机名保留为 rserver1 和 rserver2 解决方案 所有这些命令都是从本地系统运行的.这是以这样一种 ..
发布时间:2021-07-07 19:11:45 其他开发

使用外部指针的并行化函数 (XPtr)

这个问题既不是这个问题的重复,也不是这个,是关于返回外部指针的函数. 问题来了.此后的 Rcpp 代码定义了两个函数,一个创建 XPtr,另一个可以在 XPtr 上工作. #include 使用命名空间 Rcpp;//[[Rcpp::export]]SEXP f(int n) {std::vector* v = 新的 std::vector;for(int i = 0; i push_ba ..
发布时间:2021-07-03 18:46:44 其他开发

如何设置群集从属节点(在Windows上)

我需要在所有Windows的15台机器(每个4核)上运行数千个模型。我开始学习 parallel , snow 和 snowfall 软件包和阅读了一堆介绍,但是他们主要关注母版的设置。 关于如何在Windows上设置工作节点(从节点)的信息很少。信息通常是矛盾的: 有人说SOCK集群实际上是最简单的解决方法,其他人则认为在Windows上,SOCK群集设置非常复杂(sshd设置),最好的方法是M ..
发布时间:2020-10-03 02:24:18 其他开发

R并行-parRapply无法正常工作

我正在对开发中的软件包进行一些单元测试.其中一项测试失败.具体来说,我有代码的并行版本和非并行版本.非并行版本可完美运行.并行版本未通过单元测试,但似乎没有道理的错误. ## load my development package. library(devtools) # for install_github install_github("alexwhitworth/imputation" ..
发布时间:2020-05-24 21:41:51 其他开发

向量化和并行化列表分解

下面是一些代码,该代码生成一个data.frame的列表,然后将该原始列表转换为一个新列表,每个列表元素具有每个数据帧的行列表. 例如. -l1的长度为10,每个元素都是具有1000行的data.frame. -l2是长度为1000(nrow(l1[[k]]))的列表,每个元素都是长度为10(length(l1))的list,其中包含来自l1 元素的行向量 l1 ..
发布时间:2020-05-02 08:38:12 其他开发