如何使用Boost库在C ++与Rcpp [英] How to use Boost library in C++ with Rcpp

问题描述

我在 R 3.0.0 上使用 Rcpp 包。我想尝试 此示例 ，但我不能，因为我不知道如何使用 Boost 。

我在目录/ Users / giorgi / boost_1_53_0中安装了Boost，因此我设置了 Sys.setenv（PKG_CXXFLAGS= - I / Users / giorgi / boost_1_53_0）但我不知道我在做正确的事情。对不起，我对这个东西很无知！

解决方案

我会尝试几件事：

1. 使用Boost编写一个三行独立的C ++程序，并进行编译。这只是为了证明你自己拥有 -I / some / dir 标志。




2. 编写一个简单的Rcpp函数并使用 sourceCpp（）编译和加载它。



3. 文件〜/ .R / Makevars ，并将 -I 标志从1.这里设置为 CXXFLAGS 或 CFLAGS 这两个将被 R CMD ... ，因此 sourceCpp（）。




4. 如果一切都失败，添加 LinkingTo：BH 作为CRAN包BH提供了可以使用的Boost头（一旦你安装BH）。

编辑，大约1 1/2年后

您也可以在此代码中使用 // [[Rcpp :: depends（BH）]]
$ b

  #include< Rcpp.h> 
 #include< boost / math / common_factor.hpp> //包含在BH 
 
 // [[Rcpp :: depends（BH）]] 
 
使用命名空间Rcpp; 
 
 // [[Rcpp :: export]] 
 int computeGCD（int a，int b）{
 return boost :: math :: gcd（a，b）; 
} 
  

它在同时更新Rcpp和BH的同时构建和运行正常：

  R>库（Rcpp）
 R> sourceCpp（/ tmp / simpleBoost.cpp）
 R> computeGCD（6，15）
 [1] 3 
 R> 
  

I am using Rcpp package on R 3.0.0. I am trying to run this example, but I cannot because I don't know how to use Boost.

I installed Boost in the directory /Users/giorgi/boost_1_53_0 therefore I set Sys.setenv("PKG_CXXFLAGS"="-I /Users/giorgi/boost_1_53_0") but I am not sure I am doing the right thing. Sorry but I am quite ignorant with this stuff!

解决方案

I would try a few things:

1. Write a three line standalone C++ program using Boost, and compile it. This is just to prove to yourself that you have the -I/some/dir flag right.

2. Write a simple Rcpp function and use eg sourceCpp() to compile and load it.

3. Create a file ~/.R/Makevars and set the -I flag from 1. here as either one one of CXXFLAGS or CFLAGS both of which will be used by R CMD ... and hence sourceCpp().

4. If everything else fails, create a small package and add LinkingTo: BH as the CRAN package BH provides Boost headers you can use (once you install BH).

Edit, about 1 1/2 years later

You can also use a // [[Rcpp::depends(BH)]] as eg in this code

#include <Rcpp.h>
#include <boost/math/common_factor.hpp>  // included in BH  

// [[Rcpp::depends(BH)]]    

using namespace Rcpp;

// [[Rcpp::export]]   
int computeGCD(int a, int b) {
  return boost::math::gcd(a, b);
}

which builds and runs just fine as we updated both Rcpp and BH in the meantime:

R> library(Rcpp)
R> sourceCpp("/tmp/simpleBoost.cpp")
R> computeGCD(6, 15)
[1] 3
R> 

这篇关于如何使用Boost库在C ++与Rcpp的文章就介绍到这了，希望我们推荐的答案对大家有所帮助，也希望大家多多支持IT屋！