spatstat相关内容

R中多边形的CRATING核密度估计

我有一个多边形的shapefile和分布在这些多边形上的另一个点。我想为每个多边形创建一个基于它所包含的点的核密度估计。不幸的是，我只能使用MASS包中的kde2d函数创建平方的KDE。我希望KDEs被塑造成多边形。 有什么建议吗？ kde1 ..
发布时间：2022-07-21 09:24:38 其他开发

Voronoi镶嵌的共享边表

我正在尝试基于spatstat库的dirichlet()函数生成的Voronoi镶嵌(也称为Dirichlet镶嵌或Thiessen多边形)创建一个多边形邻接表。例如，在下图中，右上角和右下角的瓷砖各有2个邻居，右中瓷砖有4个邻居，其余两个瓷砖各有3个邻居。我想捕获表中的邻居对，理想情况下捕获它们共享的边界线的长度：例如，‘Tile1’、‘Tile2’、‘Shared_Edge_Length’。 ..
发布时间：2022-06-26 21:36:45 其他开发

空间分离的蒙特卡罗检验

我很难解释我从spatstat中的隔离.test方法得到的结果。然而，我有三个不同的点模式A，B，C，我想证明C和B是相关的，而A和B不是。您可以在此图中看到强度的核估计： 但是使用spatstat包在R中计算它，我总是得到相同的p值，尽管测试统计T是不同的…这怎麽可能？在这种情况下，测试统计数据T意味着什么？为什么我会得到完全相同的p值？ 我希望你能帮助我在这次蒙特卡洛测试中做错了什 ..
发布时间：2022-05-29 22:46:20 其他开发

使用 spatstat 进行点模式分类:我做错了什么?

我正在尝试使用 spatstat 将双变量点模式分类为组.这些图案来源于癌症淋巴结的整个幻灯片图像.我训练了一个神经网络来识别三种类型的细胞(癌症“LP"、免疫细胞“bcell"和所有其他细胞).我不想分析所有其他细胞，而是使用它们来构建淋巴结形状的多边形窗口.因此，要分析的模式是多边形窗口中的免疫细胞和癌细胞.每个模式可以有几个 10k 癌细胞和最多 2mio 免疫细胞.图案属于“小世界模型"类 ..
发布时间：2021-08-30 18:48:58 其他开发

将 sf 转换为标记的 ppp

我使用下面的代码成功地将一个 sf 对象转换为 ppp: sf_owin = maptools::as.ppp.SpatialPointsDataFrame(as_Spatial(sf_points__flat)) sf_points__flat 看起来像这样: 简单的特征集合，包含 131 个特征和 3 个字段几何类型:多点尺寸:XYbbox:xmin:-1932934 ymin: ..
发布时间：2021-07-23 19:44:26 其他开发

Spatstat中的Quadrats

我现在正在做探索性分析，目的是绘制一个四边形图，确定是否存在完全的空间随机性(在视觉上和使用卡方检验)，等等.但是，我在绘制四边形图时遇到了麻烦.我以前曾问过这个问题，导致我重新规划了数据. 这是我的代码: library(rgdal)#在R中带来空间数据library(spatstat)#空间统计库(maptools)图书馆(光栅)#加载nyc邮政编码边界多边形shapefiles-- ..
发布时间：2021-05-31 20:03:26 其他开发

如何从随机自拦截线(R中的psp)列表中生成分段列表?

我正在使用X=rpoisline(4)生成线并用plot(X)绘制它们. 在X$ends中，我的坐标和交点与selfcrossing.psp(X)(在R中，带有spatstat的library(spatstat)). 我需要获取线段及其坐标的列表，并能够对其进行操作(更改其方向，位置，交点...).这些线段必须由一条线与另一条线和窗口的交点定义. 那么，我是否缺少一种简单的方法来将不相 ..
发布时间：2020-07-08 19:23:54 其他开发

生成聚集的spatstat标记?

我想知道是否有人知道如何在spatstat中分配标记，以便它们倾向于在空间上聚集?我有一组经纬度坐标，我想将其分为4组.我想出了如何使用以下代码将标记/组随机分配给这些点: as.ppp(data, window ,marks=factor(sample(1:4,replace=TRUE))) 但是我不知道如何分配标记，以使各组趋向于占据彼此更近的点.更为复杂的是，我还希望每个组中的点数 ..
发布时间：2020-07-08 19:22:51 其他开发

如何在符合逻辑回归正交方案的泊松品脱过程模型中包括调查权重?

是否可以在符合逻辑回归正交方案的泊松点过程模型中包含权重?我的数据是分层样本，我想说明这种抽样策略，以便获得有效的人口水平预测. 解决方案 以下是@ adrian-baddeley回答的几行内容. 如果您已经设置了相关问题，并且我们假设您在与quadscheme点的顺序相同: library(spatstat) X ..
发布时间：2020-07-08 19:22:48 其他开发

通过`density.ppp`向内核函数发出粘贴参数

我目前正在与 density.ppp 函数，并使用我自己设计的不同内核函数调用它. 为此，我需要通过... arglist通过density.ppp将一些参数传递给我的内核函数. 在一种情况下，这是行不通的，即如果我想通过边缘校正来计算at = "points". 在densitypointsengine中说 # evaluate edge correction weights ..
发布时间：2020-07-08 19:22:46 其他开发

用作as.linnet对象的数据框对象

我有一个data.frame对象，可以轻松地将其转换为 spatialpointdataframe ，然后将其转换为 spatiallinesdataframe ，但是当我尝试覆盖 as.linnet 不会读取标记 X Y roadID 1 177321.3 3378163 1 2 177321.4 3378168 1 3 177321.4 ..
发布时间：2020-07-08 19:21:37 其他开发

用R中的LinearK函数分析章鱼的捕获量

希望您能帮助我解决我找不到的问题.抱歉，如果我在写这篇文章时犯了一些错误，我的英语现在有点生疏了. 这是问题.我有要在R中分析的.shp数据..shp可以是代表我们设置为捕获章鱼的陷阱线的线，也可以是直接位于这些线上方的点，表示我们已经放置过的点. 我要回答的问题是:章鱼在统计上是否分组? 经过一番调查，在我看来，我需要使用Maptools，SpatStat和Sp库来使用R及其l ..
发布时间：2020-07-08 19:21:34 其他开发

将两个多边形区域合并为R中的单个多边形区域

我是R中处理空间数据和多边形的新手. 我有两个分别从Google Earth中提取的两个多边形的形状文件.因此，基本上第一个形状文件是一个位置(例如购物中心等)，第二个形状文件是第一个位置周围三公里的半径.我将两个形状文件都读取为R作为SpatialPolygonsDataFrames.我使用以下代码: library(maptools) library(sp) library(spa ..
发布时间：2020-07-08 19:21:32 其他开发

到源的距离的空间聚类定向测试

我有一个动物位置的空间数据集，如源(半径为5 km的圆形图案)周围的(x，y)点.在考虑方向性的同时，我需要测试这些点是否相对于距源较远的位置聚集(或排斥)在源周围. 我尝试过的事情: 检查了最近的邻居和Ripley的K-无法弄清楚如何合并到源或方向的距离(再加上，看起来Ripley的期望矩形的窗口，而我的是圆形的) 将数据划分为基本方向(N，E，S，W)和距离区间，并计算每个距离/方向 ..
发布时间：2020-07-08 19:21:27 其他开发

spatstat中的单位长度

我对Spatstat中的KEST函数有一个非常简单的问题. KEST图形输出我正在使用Spatstat中的KEST函数来评估数据集中的空间随机性.我使用ripras函数指定空间域，上传了散布在伦敦的经度和纬度值，并将其转换为PPP对象.当我在ppp上运行KEST分析并绘制图形时，最终在x上得到r值，但是尽管我知道这是一种距离测量，但我不知道它使用的单位.我得到以下摘要输出: Planar p ..
发布时间：2020-07-08 19:21:23 其他开发

将sf多边形对象用作spatstat中的窗口

您好，所有潜在的帮助者， 我有一个从tigris包获得的SpatialPolygonDataFrame对象，我想在创建ppp对象时将其用作多边形窗口.这是我尝试过的: # Needed packages library(spatstat) library(sf) # Download geospatial data for Lee county in Alabama (home of ..
发布时间：2020-07-08 19:21:20 其他开发