survival-analysis相关内容

R与STATA中的COX比例风险模型

我正在尝试使用以下数据在R中复制来自STATA的Cox比例风险模型估计http://iojournal.org/wp-content/uploads/2015/05/FortnaReplicationData.dta Stata中的命令如下: stset enddate2009, id(VPFid) fail(warends) origin(time startdate) stcox ..
发布时间:2022-04-11 20:35:39 其他开发

将函数与 R 中的向量参数集成

我对之前的帖子有类似的挑战:如何将向量传递给整合功能 我有一个函数,我想对曲线下的面积进行积分. 一、[生存]功能: surv score 来自风险计算器,它调整生存估计.患者有不同的分数,例如: score 计算所有 7 位患者的 surv 很容易,如果我们有一个特定的时间点 x: surv(5, score) # 生存到第 5 年[1] 0.7161497 0.691 ..
发布时间:2021-09-17 19:10:15 其他开发

使用 R 中“rpart"包中的生存树来预测新的观察结果

我正在尝试使用 R 中的“rpart"包来构建生存树,我希望使用这棵树然后对其他观察结果进行预测. 我知道有很多关于 rpart 和预测的 SO 问题;但是,我还没有找到任何可以解决(我认为)特定于将 rpart 与“Surv"对象一起使用的问题. 我的特殊问题涉及解释“预测"函数的结果.一个例子很有帮助: 库(rpart)图书馆(OIsurv)# 制作数据:set.seed(4)d ..
发布时间:2021-09-09 19:35:27 其他开发

如何预测R中的生存概率?

我将名为 veteran 的数据存储在 R 中.我创建了一个生存模型,现在希望预测生存概率.例如,具有 80 karno 值、10diagtime、age 65 和 prior=10 和 trt = 2 寿命超过 100 天? 在这种情况下,设计矩阵是 x = (1,0,1,0,80,10,65,10,2) 这是我的代码: 图书馆(生存)附上(老手)weibull ..
发布时间:2021-06-21 19:35:44 其他开发

在 `ggsurv` 图中(或在 `plot` 中)区分不同类型的每条线

我正在使用 Rstudio.我正在使用 GGally 包中的 ggsurv 函数为我的数据绘制 Kaplan-Meier 曲线(用于生存分析),来自教程 此处.我使用它而不是 plot 因为 ggsurv 自己处理图例. 如链接所示,多条曲线按颜色区分.我想根据线型进行区分.本教程似乎没有任何选项.以下是我的命令: surv1 lty.est=3(或 2)为所有行提供相同的虚线.我希望 ..
发布时间:2021-06-18 19:07:20 其他开发

游泳者生存图

有没有一种简单的方法可以在 R 中生成游泳者图?与 KM 曲线中的数据相同,但每个个体的生存都用一条线表示.示例: 我搜索了 stackoverflow、R-help 邮件列表,并咨询了 Google 博士,但没有得到明显的答案,尽管我的搜索技术可能不是最理想的.谢谢! **** 添加 ****为不恰当地提问而道歉 - 这是我第一次!玩玩,我已经能够做到以下几点: OS Death ..
发布时间:2021-06-18 19:01:23 其他开发

根据Survreg预测绘制生存曲线

我在生存分析方面还比较陌生,并且已经使用了一些标准的电信用户流失数据示例,下面的示例称为“电信": 电信公司--read.csv(文本=“状态,帐户长度,区域代码,国际计划,Day_Mins,Day_Calls,Day_Charge,Eve_Mins,Eve_Calls,Eve_Charge,Night_Mins,Night_Calls,Night_Charge,Intl_Mins,Intl_M ..
发布时间:2021-05-10 20:11:26 其他开发

将字符串数据包装在ggplot2的surv_miner的风险表中

对于在RStudio中用surv_miner构造的Kaplan Meier曲线,我具有以下风险表: Kaplan Meier曲线 我想在风险表中将文本字符串换行,以使数字位于顶部,而百分比(用括号括起来)位于数字下方的另一行,以便它们都适合表.我尝试使用stringr包,但我不太了解如何将其合并到主题中.任何帮助,将不胜感激.我只发布了我的代码,因为添加实际的生存数据有些棘手.但是,如 ..
发布时间:2021-05-10 20:08:23 其他开发

R:绘制个人预测

我正在使用R编程语言.我正在尝试按照本教程进行操作: https://rdrr.io/cran/randomForestSRC/man/plot.competing.risk.rfsrc.html 本教程显示了如何使用“生存随机森林".algorithm-用于分析生存数据的算法.在该示例中,“叶面"为白色.使用数据集,使用生存随机森林算法来分析观察到的经历“状态1"的即时危险.对比“状态2" ..
发布时间:2021-04-29 19:01:18 其他开发

删除缺失的数据值

我删除了原始帖子,以便能够发布更大版本的数据集.实际上总共有418行. 以下是我正在进行的生存分析的数据.第一列是ID号,其他列标记为V2-V20.有许多丢失的数据用“."表示. 我使用 coxph()函数获得以下信息: #将生存时间保存在向量"time"中.时间= surv.df [,"V2"]#将关于检查状态的信息保存在向量“状态"中.在考克斯的回归中;死亡代码应始终设置为1.状 ..
发布时间:2021-04-28 20:44:53 其他开发

WinBUGS Weibull网络元分析

我目前正在进行多项临床试验中生存数据的荟萃分析. 为此,我使用相同的方法从发布的分析中获取代码.但是,当使用已发布的分析中的数据运行此代码时,我无法复制其结果.实际上,结果无法收敛到任何合理的估计. 代码本身(不包括数据)应正确无误,因为它直接来自作者.我认为问题必须与初始值或 采样运行方式的参数,但在多次播放之后 初始值,老化时间,变薄等...我没有得到有意义的结果. 任何人都 ..
发布时间:2020-07-14 04:21:27 其他开发