graph-tool相关内容

图形工具中带有边缘捆绑和标签的圆形布局

我对图形可视化和图形工具(gt)等软件非常陌生.我的主要领域是数学,但我对 Python 和一般的编程有点熟悉.但是,我不是程序员,所以我的代码可能不够优雅;任何改进建议将不胜感激. 说明: 我非常喜欢带有边缘捆绑的圆形布局,用于可视化非常大的图形.作为一个例子,我正在尝试使用美妙的 Python 模块 graph-tool 蒂亚戈·佩肖托 (Tiago Peixoto).为此,我使用 ..
发布时间:2021-09-18 19:24:33 其他开发

图形工具是否有投影二部图的方法?

我正在尝试将二部图投影到两个单模图中. 我想使用双重投影方法分析二部图.我一直在使用 NetworkX,但我想尝试使用图形工具,因为它声称效率更高.我的图有可能很快变得很大,所以我想使用最有效的方法/包.包图形工具声称效率更高,我想尝试一下,但我找不到使用它来投影二部图的方法.有谁知道这是否可以使用图形工具?我找到的唯一信息是创建者要求提出类似问题的人创建票证,以便他/他们可以开始处理它,但 ..
发布时间:2021-06-22 18:30:49 Python

图形工具在导入时出现裂纹

使用Python 2.7我尝试导入图形工具: from graph_tool.all import * 每次执行上述命令时,都会返回以下错误,并且Python崩溃. dyld:懒惰的符号绑定失败:找不到符号: __ZN5boost6python6detail11init_moduleEPKcPFvvE引用自:/usr/local/lib/python2.7/site-package ..
发布时间:2020-06-17 19:05:53 其他开发

将边列表加载到图形工具中

我想将边列表加载到图形工具中.我列表中的顶点索引不是顺序的,因此我希望将它们自动添加为vertex_properties.据我了解,这应该使用add_edge_list完成,但是我发现未创建vertex_property"n​​ame".另一方面,load_graph_from_csv确实可以工作: from graph_tool.all import * import numpy as n ..
发布时间:2020-06-17 19:05:48 其他开发

从graph_tool包中继承Graph

我正在尝试从graph_tool包中为Graph子类化,以便在Python中进行某些图形分析(以便我可以生成自己的某些函数,但仍仍使用Graph_Tool的函数),但似乎无法使用graph_tool的图形生成器方法. 我首先导入我的课程: import graph_tool.all as gt import numpy.random as np np.seed(42) 我尝试了__ ..
发布时间:2020-06-17 19:05:46 Python

配置:错误:找不到CGAL库

我的最终目标是让python软件包graph_tool在我的系统上运行,如果可能的话,还可以在ipynb上运行.我已经brew install graph-tool,如此处所示,但这还不够. 因此,我遵循 Anaconda说明,并且我取得了不错的进展,直到找不到库. 注意:为了遵守Anaconda的说明,我安装了anaconda3并创建了一个新的conda环境(名为py36env)来c ..
发布时间:2020-06-17 19:05:38 其他开发

激活graph_tool的与cairo相关的功能

一段时间以来,我一直在使用图形工具库,到目前为止,我还没有使用过确实使用了大多数绘图功能.今天,当尝试使用 graph_tool.draw.graph_draw 我意识到我最初配置图形工具时没有 cairo , ./configure --disable-cairo ,这正是graph_draw使用的图形库.如果我现在安装cairo,是否有一种方法可以激活依赖cairo的graph_to ..
发布时间:2020-06-17 19:05:34 Python

图形工具中有关嵌套块模型的基本问题

关于 graph-tool library 中的minimize_nested_blockmodel_dl 函数.有没有办法找出哪个顶点落在哪个块上?换句话说,要从每个块中提取一个列表,其中包含其顶点的标签. 对于网络理论的业余爱好者(例如绘制有向边的正方形是为了暗示所考虑的两个块之间的基础边的主方向?可以使用不同的颜色很好地显示块,但是在非常概念上,顶点的块分类背后是哪些类型的图案或边线/ ..
发布时间:2020-06-17 19:05:25 Python

python graph-tool访问顶点属性

对于我当前的项目,我想使用图形工具库,因为它们声称是最快的: https ://graph-tool.skewed.de/performance .我有一些算法(最短路径等)可以在非常大的网络上运行,所以速度越快越好! 第一个问题:这是“最快"的说法吗? ;) 在尝试构建适合我需求的图形工具图形时,我发现无法以有效的方式访问顶点属性.也许我错过了什么? 我的问题是,现在可以以更有 ..
发布时间:2020-05-17 19:03:34 Python

与Networkx相比,图形工具出奇的慢

查看了令人印象深刻的性能比较后,我决定尝试绘制图表-工具.因此,为了进行比较,我编写了使用这两个程序包生成随机树的代码. 图形工具代码: import numpy as np import graph_tool.all as gt # construct an initial graph with two nodes and one link n = 5000 G = gt.Grap ..
发布时间:2020-05-17 18:57:43 Python

python图形工具中的显式顶点位置

我正在使用python图形工具。要绘制图形,它使用 graph_draw 功能。我想明确地发送顶点位置到点引擎。事实证明,我可以传递名为 pos 的属性映射。我尝试将其定义为 v_pos = g.new_vertex_property(“vector)”,其中 g 是我的图形。我不确定这是否是正确的方法。 有一个代码片段,您可能会发现它有帮助。 pos = gt.r ..
发布时间:2018-05-25 17:42:13 Python

所有使用graph_tool的最短路径

我想知道graph_tool中是否有内置函数可用于查找从节点s到节点t的所有最短路径。如果没有,有什么办法可以在某种程度上使用shortest_distance()(在模块graph_tool.topology中)或shortest_path()(在模块graph_tool.topology中)或任何其他内置函数)来计算所有最短路径,而不是只有其中一个(我正在处理一个有大约50万个节点的图)。 ..
发布时间:2018-05-25 17:32:43 Python